Климен не является противозачаточным средством. 
Перед началом применения Климена рекомендуется пройти общемедицинское и гинекологическое обследование (включая исследование молочных желез) для исключения вышеизложенных противопоказаний. При длительном применении Климена следует проходить контрольные медицинские обследования каждые 6 мес. 
Перед началом лечения вторичной аменореи необходимо убедиться в отсутствии у пациентки пролактин-продуцирующей опухоли гипофиза. 
При возникновении повторных кровотечений в начальный 3-месячный период лечения Клименом необходим контроль врача без прекращения приема препарата. 
Прием препарата необходимо прекратить при появлении впервые необычно сильных, мигренеподобных или часто возникающих головных болей, при неожиданных нарушениях зрения или слуха, при первых признаках тромбоза (необычные боли в конечностях, отеки, при болях и чувстве сдавления в грудной клетке), при появлении желтухи, усилении и учащении эпилептических приступов, при значительном повышении АД, наступлении беременности. 
При назначении ЗГТ особенно тщательно следует контролировать состояние здоровья у пациенток с эпилепсией, доброкачественными опухолями молочной железы, с бронхиальной астмой, мигренью, порфирией, отосклерозом, системной красной волчанкой, малой хореей. 
Для предупреждения беременности в пременопаузе пациенткам рекомендуется, в случае необходимости, применять негормональные методы контрацепции (за исключением календарного метода Кнауса-Огино и температурного метода). 
При продолжительном лечении препаратом увеличивается вероятность прекращения менструаций. После перенесенного вирусного гепатита прием Климена возможен лишь через 6 мес. 
Применение препарата следует прекратить за 6 недель до проведения плановых хирургических операций, а также в случаях назначения длительного постельного режима (например после несчастных случаев). 
При применении Климена возможно изменение толерантности к глюкозе, поэтому у пациенток с сахарным диабетом может потребоваться коррекция доз гипогликемических препаратов.